Следы древних вирусов разбросаны по всему геному человека, встроенные в структуру ДНК. Ученые уже знали, что некоторые из этих вирусных артефактов могут «активироваться» в раковых клетках и потенциально способствовать прогрессированию заболевания, но теперь новое исследование показывает, что вирусы активны и в десятках здоровых тканей.
Фото из открытых источников
«15 или 20 лет назад считалось, что почти все эти эндогенные ретровирусы, находящиеся в геноме, а их тысячи, в нормальных тканях молчат», — сказал Мэтью Бендалл, доцент кафедры компьютерных биологических исследований в медицине Weill Cornell Medicine в Нью-Йорке. «Они были отнесены к этой категории «мусорной ДНК», части нашего генома, которые не имеют никакой функции».
Это предположение было поставлено под сомнение в последние шесть лет или около того, поскольку ученые разработали более чувствительные методы изучения активации генов. Но самые последние исследования были сосредоточены только на активации древнего вируса в раковых опухолях и в небольшом количестве здоровой ткани рядом с этими опухолями. Новое исследование, опубликованное недавно в журнале PLOS Biology, дает более широкое представление о том, насколько активны эти остатки вируса в организме.
«Это исследование действительно является одним из первых взглядов на то, что происходит в нормальных тканях», — сказал Бендалл. «Мы все экспрессируем во всех наших тканях, во всех наших клетках некоторые из этих вирусных остатков, и я думаю, что это исследование действительно важно, чтобы показать это».
Новое исследование привлекло данные из проекта Genotype Tissue and Expression (GTEx), базы данных, которая включает образцы тканей, взятые после смерти почти у 950 человек. Эти образцы включают 54 типа здоровых тканей, обнаруженных по всему телу, в том числе в головном мозге, сердце, почках, легких и печени.
Чтобы создать базу данных, исследователи проанализировали эти ткани, чтобы увидеть, какие из их генов были «включены», о чем свидетельствует присутствие в их клетках специфических нитей РНК. РНК, молекулярный родственник ДНК, копирует инструкции из участков генома, а затем передает их на своего рода фабрики по производству белков в клетках, чтобы те могли выкачивать необходимые белки. Некоторые молекулы РНК выполняют в клетке другие функции, в том числе помогают строить эти новые белки или включать и выключать гены.
В обширной базе данных GTEx авторы исследования искали доказательства существования активных «человеческих эндогенных ретровирусов» (HERV), то есть кусочков древних вирусов, вплетенных в геном. В частности, они проверили группу HERV под названием «HML-2», которая была введена в человеческую родословную относительно недавно — по крайней мере, по эволюционным стандартам. При этом некоторым из самых молодых примеров вирусов HML-2 всего несколько сотен тысяч лет, и они обнаружены только в геноме человека, а это означает, что они не обнаружены ни у одного из наших родственников-приматов.
Источник: esoreiter.ru